二代测序用户调查:数据分析注释为瓶颈

今年The Scientist杂志与另外一家国际市场情报与咨询公司Frost & Sullivan合作，展开了一项新一代测序技术使用情况的用户调查活动。

调查结果显示，目前大部分新一代测序技术研究工作主要集中在基础研究和疾病相关的研究方面。这一调查受访者中约有40%的研究人员参与了新一代测序研究，不过下半年的人数可能还会增加4%，还有一半受访者表示在未来的两年内，将计划进行着方面的研究。

目前新一代测序技术流程中最大的瓶颈是分析和注释数据所花费的时间太长，大约有 32%的受访者都将这些工作外包给生物信息学同事，或者第三方公司。

那么影响购买者购买仪器的因素有哪些呢？

调查显示，数据的准确性和操作成本，这两者是购买测序设备的最重要采购标准。但是如果两种仪器的数据精确度相同，那么操作成本、应用的广泛性，读长和通量就成为了第二重要的参考因素。

平均花费的时间：

NGS 工作流程的最大瓶颈是分析和注释数据所花费的时间太长。有四分之一的研究人员表示NGS数据分析需要至少一周时间，还有32%的受访者将这一工作外包给其他生物信息学组同事或第三方公司。

影响购买者选择的因素：

数据的准确性和操作成本，这两者是购买测序设备的最重要采购标准。但是如果两种仪器的数据精确度相同，那么操作成本、应用的广泛性，读长和通量就成为了第二重要的参考因素。

NGS软件分析预算：

每年NGS 数据注释软件的预算是外包费用的两倍多，目前NGS 软件整体平均预算约为8,500 美元，不过这一数据还表明，内部和外包所花费的费用存在巨大差异，前者的费用约为13,000- 14,000美元，后者的费用为4500-6300 美元）。

参考文献：

Next-Gen Sequencing User Survey